El Comité de Administración está formado por cinco miembros. Dos de ellos son nombrados por el sector productivo, dos son representantes del Gobierno elegidos por el Gobernador de la Provincia del Huasco (entre los servicios ligados al sector empresarial agrícola) y último, corresponde a un asesor técnico definido por las almazaras de la provincia.

El Comité cuenta con un Secretario Ejecutivo, quién tiene el carácter de ejecutor /coordinador de las acciones de certificación y de promoción de la Denominación de Origen (D.O) en los mercados consumidores.

Asimismo, en su carácter de Secretario Ejecutivo, tiene la responsabilidad de preparar y organizar las reuniones ordinarias y extraordinarias del Comité y llevar a efecto los acuerdos definidos en dicho directorio.